Джамба отправляется в космос для исследований в своей Лаборатории Злого Гения, Пликли начинает преподавать, а Стич готовится стать капитаном звездолёта. Лило грустит из-за разлуки с друзьями, но верит, что сила «алоха», с которой она их отпускает, обязательно к ней вернётся. Вскоре всем им предстоит воссоединиться, ведь из межгалактической тюрьмы сбежал доктор Хомяксвиль. Он клонировал нового экспериментального существа, созданного когда-то Джамбой, и теперь старым друзьям снова придётся объединиться для борьбы с угрозой.