Таинственная катастрофа в подводном тоннеле Токийского залива парализует работу всех экстренных служб мегаполиса. Чтобы выяснить причину и найти решение, собирается экстренное совещание во главе с министром по делам катастроф. Чиновники ещё не подозревают, что это лишь первые признаки настоящего бедствия. Вскоре над Токио нависает тень древнего и беспощадного чудовища — Годзиллы, чьё появление грозит полным уничтожением города, а привычные методы борьбы с катастрофами оказываются совершенно бесполезными перед лицом этого титанического разрушителя.