В детстве Дзин Микурия часто играл в старом синтоистском храме под священным деревом нагей. Повзрослев, он обнаружил, что храм разрушен, а дерево спилено. Будучи художником и человеком, чувствительным к природе, Дзин взял часть древесины и вырезал из неё статую девушки. Его искренняя молитва оживила деревянную фигуру, и на свет появилась Наги — земное воплощение богини-хранительницы этих мест. Однако её силы оказались ослаблены, и для выполнения обязанностей ей потребовалась помощь самого Дзина. Вдохновившись увиденным по телевизору аниме о волшебницах, Наги решает вести жизнь обычной школьницы, а в свободное время бороться со злом, назначив Дзина своим верным помощником.