Братья Элрик снова в деле: Эдвард и закованный в доспехи Альфонс, будучи государственными алхимиками, отправляются на запад, чтобы поймать опасного беглеца. Их путь лежит в таинственный город Милос с его сложной историей. Беглец оказывается могущественным алхимиком, чьи методы непохожи на всё, что братья видели раньше, и он ищет свою сестру Джулию Крит. Впереди у Эда и Ала — схватка не только с ним, но и с преследующими их оборотнями-химерами. Чтобы спасти Джулию и предотвратить надвигающийся конфликт, им предстоит раскрыть секреты древней алхимии, которые веками хранил Милос.